Piattaforma genomica e trascrittomica

La piattaforma genomica presente in BRIT racchiude la strumentazione necessaria per il processamento Higth throughput in ambito di sequenziamento e valutazione dell’espressione genica. È possibile, infatti, eseguire un intero flusso di Next Generation Sequencing (NGS), comprendente la valutazione della qualità delle librerie, mediante elettroforesi su chip, il sequenziamento massimo e parallelo su piattaforma illumina MiSeq e un ulteriore controllo mediante protocollo SNP Genotyping in qRT-PCR. La piattaforma di Genomica offre anche la possibilità di verificare alterazioni del corredo proteico in Custom Array Reader oltre che procedere alla conta di trascritti mediante l’utilizzo della tecnologia Nanostring. La strumentazione è quindi in grado di soddisfare le maggiori applicazioni in campo della genomica e trascrittomica comprendendo workflow sperimentali che spaziano dalla 16s Microbioma. Al sequenziamento di interi geni fino a protocolli di Amplicon mRNA sequencing. 

HiScanSQ System

HiScanSQ System
Illumina

HiScan Reader is a high-performance scanner, capable of analyzing next-generation sequencing flow cells and Illumina BeadArray products. The SQ module enables a broad range of array-based applications such as SNP Genotyping and CNV analysis, gene expression, methylation analysis.

Main instrumental features:

Laser Microarray Scanner

Laser Microarray Scanner
Innopsys InnoScan 710

Simultaneous confocal 2-color fluorescence microarray scanner (635 nm and 532 nm) with adjustable scan resolution (3-40 µm). It is provided with Mapix® microarray image analysis software application, computer and monitor. It detects Cy3, Alexa 3, Alexa 546, Alexa 555, Cy5, Alexa 5, Alexa 647 and Alexa 660 fluorophores.

Main instrumental features:

Microarray Spotting System

Extreme Protein Edition Microarray Spotting System
ArrayIt SpotBot®

The SBXPRO system prints 10,000 samples (0.2-1.25 μl per sample) onto 28 glass substrate slides in 12 hours. Liquid-cooling deck and proteincooling tubes enable antigen, antibody, peptide, lysate and reverse-phase protein microarrays.

Main instrumental features:

nCounter System

nCounter System
NanoString Technologies

The nCounter Analysis System utilizes a novel digital color-coded barcode technology that is based on direct multiplexed measurement of gene expression and offers high levels of precision and sensitivity (<1 copy per cell).